研究プラン：平岡 微生物群集解析とT-RFLP
サンプルを微生物群集解析に出す場合、同じサンプルをT-RFLPにも提出すれば、その後のサンプル解析が単純化できるか？
http://www.appliedbiosystems.jp/website/PDFOUT/109922
「T-RFLP実験の後にアプライドバイオシステムズのMicroSeq® 微生物同定用シーケンスキット」
「T-RFLP解析
DNA単離、精製、PCRによる増幅は、Jaci Batista博士（ラスベガス大学、ネバダ州）の協力のもとで行われました。
PCRのステップで用いた
フォワードプライマー（ 5 ' - C A G G C C T A A C A C A T G -CAAGTC-3'）はFAM®色素で、
リバースプライマー（5'-ACGGGCGGTGTGTACAAG-3’）はPET™色素でラベルしました。
ラベルされたPCR産物は精製し、制限酵素（AluIまたはHhaI）で消化しました。」
「消化したPCR産物の一部を20分の1に
希釈し、その一部(1μl)をGeneScan™ -
500 LIZ®サイズスタンダードと混合後、変
性操作を行います。次に、サンプルを
3130xl ジェネティックアナライザにより
FragmentAnalysis36_POP7ランモ
ジュールとG5ダイセットを用いて電気泳動
にかけます。」
